V EP nie je povolený prenos embryí, ani synchronizácia ruje. Tieto postupy nie sú v súlade s prírodným cítením ekologických poľnohospodárov.
Kupírovanie chvostíkov prasiat je zakázané.
Ekologické krmivá neobsahujú žiadne stimulátory rastu alebo úžitkovosti.
Teľatá sú najmenej 3 mesiace kŕmené prirodzeným biomliekom a nie sušeným mliekom.
Prasatá v EP majú možnosť výbehu, prasnice a prasiatka už od 24. dňa po narodení.
V stajni je zakázané používať elektrické imobilizéry (el. zariadenie obmedzujúce pohyb zvierat). Kravy nedostanú el. ranu, keď urobia potrebu na mieste, ktoré nie je na to určené.
Každá nosnica v EP má vonkajší výbeh najmenej 4m2, teda dostatočne veľkú plochu. Ekologický poľnohospodár presúva výbeh tak, aby zostával stále zelený.
V EP sa chovajú pomalšie rastúce plemená, preto kosti kurčiat môžu dostatočne zosilnieť.
Pre všetky zvieratá je povinný výbeh alebo pastva. Zvieratá v EO si teda môžu pravidelne užívať čerstvý vzduch, slnko, vietor i dážď.
Kravy v podnikoch EP zhodnocujú ekologické seno a trávu na biomlieko. Podľa Nariadenia Rady č. 2092/91 musí byť podiel objemových krmív u bylinožravcov najmenej 60 %.
Ekologickí poľnohospodári a veterinárni lekári používajú predovšetkým prevenciu a prírodné liečebné prostriedky a postupy. V prípade nutnosti je však povolená aj konvenčná liečba. Pokiaľ musia byť použité syntetické prostriedky, platí pre dvojnásobná ochranná lehota.
Dobrá starostlivosť pri ustajnení (čistota, starostlivosť, homeopatia) môže do dvoch rokov znížiť potrebu použitia antibiotík až o 30%. Po troch až štyroch rokoch už väčšinou nie sú antibiotiká potrebné.
Dobrými podmienkami a profesionálnou a šetrnou starostlivosťou (prevencia, prirodzené prostriedky atd.) sa zvýši podiel kráv s viac než troma laktáciami z 29% na 48%.