Prehľadné štúdie o kvalite bioproduktov z rokov 1926 až 1998 ukazujú, že listová zelenina z ekologického pestovania obsahuje o 10 až 40% menej dusičnanov. Ekologické ovocie a zelenina obsahujú viac vitamínov. Tiež pri pokusoch s možnosťou voľby krmiva dávajú zvieratá väčšinou prednosť bioproduktom pred konvenčnými krmivami.
alebo len veľmi malé množstvá spôsobené kontamináciou životného prostredia, napr. z konvenčných plôch. Bioovocie a biozelenina obsahujú priemerne 50 až 70krát menej rezíduí pesticídov ako konvenčné. Syntetické pesticídy sú v ekologickom poľnohospodárstve (EP) zakázané.
Pri používaní feromónov nemôžu samčeky škodcov (napr. obaľovačov) nájsť samičku a tak nedôjde k jej oplodneniu.
Herbicídy sú v EP zakázané. Poľnohospodári sa zbavujú burín mechanickou kultiváciou, pritom zároveň kypria pôdu.
Je zakázané používanie regulátorov rastu, urýchľovačov zrenia a pod. Je to neprirodzené a zanecháva to škodlivé rezíduá v pôde. Preto sa tieto prostriedky nesmú v EP aplikovať.